L'équipe du CDC, dirigé par Peter Farragut, doit faire face, à deux cas d'infection. Hélas, l'un des patients, Isaac, reste introuvable. Avec l'aide de Michaël, le maître de l'étrange confrérie, les scientifiques commencent à la fois leurs recherches sur l'agent pathogène et la traque du malade en fuite. Jordan, aperçoit Alan, qui semble appartenir à la secte. Elle parvient à lui parler et lui révèle son secret.