Dopo la vittoria su Jack nella Fortune Cup, Yusei viene nominato il nuovo Re dei Duelli. Mentre Yanagi informa la banda dei Signers e dei Dragon Birthmarks, Yusei viene sfidato da un uomo misterioso con una voglia a forma di ragno sul braccio che riesce a trasformare il duello in un Duello delle Ombre. Yusei è sorpreso di scoprire che il suo avversario ha un nuovo temibile tipo di mostro, un Mostro Oscuro Synchro. Nel frattempo, un reporter di nome Carly cerca di ottenere lo scoop sul nuovo Re dei Duelli.