Anna fa eseguire dei test fisici su Tyler, per verificarne l'idoneità alla riproduzione dei V, facendogli credere che sia un test di routine per i futuri piloti di navette. I livelli di fosforo risultano però troppo bassi, quindi Anna richiede di fargli un'iniezione; nel caso questa non sia sufficiente, si sbarazzerebbe del ragazzo. Nel frattempo, chiede a Lisa di "far divertire" Rafael, il candidato più promettente per la riproduzione, proveniente da Barcellona. La figlia non sembra entusiasta dell'idea e Anna è costretta ad imporglielo. Intanto Erica, sotto consiglio di John Fierro, va a Bangkok con Hobbes per incontrare i luogotenenti delle fazioni straniere della Quinta Colonna, i quali capiscono che lei ha accesso all'astronave madre dei V più di quanto loro possano sperare, ma prima di accettarla come leader indiscussa, pretendono un piano concreto e una dimostrazione di valore. Dopo l'incontro, Fierro dice a Erica e Hobbes di aver trovato a Hong Kong la dottoressa Rai grazie a un poliziotto del posto; questa ha avuto in cura molte delle madri dei bambini con il DNA manipolato come quello Tyler, quindi il trio decide di muoversi in quella direzione. Anna dice a Joshua di sospettare che Lisa soffra emozioni umane e gli chiede di mentirle, dicendole di ricordarsi com'era quella sensazione. Lisa intanto va a parlare con nonna Diana, che le consiglia di accettare l'incontro con Rafael per smorzare i dubbi di Anna. Subito dopo incontra Chad, il quale le chiede a nome di Erica di indagare sull'utilità per Anna degli umani a bordo dell'astronave. Joshua la vede di nascosto mentre lei controlla il database dell'astronave. Subito dopo le mente come ordinato da Anna, ma lei non cade nel tranello, fingendo di non sapere niente. Erica e Hobbes penetrano nel palazzo in cui si nasconde la dottoressa Rai, aiutati da Fierro (specializzato in hacking) e dal poliziotto di Hong Kong. Si scopre che è un V, e si butta dalla finestra ingoiando una pillola di autodistruzione. Erica e Hobbes riescono comunque in una pericolosa corsa contro il tempo a recuperare dei dispositivi olografici e dei passaporti dalla cassaforte della camera. Nelle olografie trovano una mappa dove ogni astronave madre corrisponde a un ragazzo, potenziale candidato per la riproduzione. Nei medicinali trovano degli insetti robotici; il "ragazzo di scienza" capisce che questi insettini sono studiati per cercare cromosomi Y e per rimuovere parti di DNA. Lisa invia a Chad i dati medici dei candidati, i migliori per ogni parametro; incrociando questi indizi col fatto che in 50 anni i V hanno migliorato il loro DNA di migliaia di volte, capiscono che Anna intende rubare anche agli umani le migliori parti di DNA per evolvere ancora la propria razza. Ryan, sopravvissuto all'esplosione, ferma per strada Jack chiedendogli una seconda chance, ma questo se ne va dicendogli che non essendo più prete non è suo compito assolverlo. Lisa non riesce ad accoppiarsi con Rafael, quindi Anna comincia a sospettare fortemente di lei, tanto dal considerare l'idea di utilizzare al suo posto l'ultimo uovo-regina che aveva tenuto da parte. Chiede a Joshua di testare sulla figlia di Ryan l'accrescimento veloce, e se questo funzionasse di far schiudere anche l'uovo. La figlia di Ryan, accresciuta e dalle difese immunitarie potenziate, non è più succube di Anna per guarire, ma riconosce solo lei come madre. Anna, in compenso, chiede di sopprimere Ryan. I luogotenenti della Quinta Colonna, visto quello che Erica è riuscita a scoprire, accettano di sottostare ai suoi ordini. Lisa torna infine da Diana, che le dice di non fidarsi di nessuno sulla nave; si scambiano un comunicatore per rimanere sempre in contatto.