Danzo pensa di avere vinto lo scontro, ma, quando tenta di utilizzare Izanagi con l'ultimo Sharingan a sua disposizione, si rende conto che Sasuke lo ha ingannato facendogli credere che esso era ancora aperto quando, invece, si era già chiuso prima che i due si dessero l'ultimo colpo. L'Hokage prende allora in ostaggio Karin. Tuttavia, Sasuke trafigge anche lei e ferisce il suo avversario. Tobi blocca il tentativo di fuga di Danzo e questi ricorda una passata missione al fianco di Hiruzen Sarutobi, sotto il comando del Secondo Hokage. Resosi conto della differenza fra lui e quello che sarebbe diventato il Terzo Hokage, Danzo si autodistrugge impedendo a Tobi di impossessarsi dell'occhio di Shisui come suo ultimo atto per proteggere Konoha.